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1沙眼衣原体除能引起化脓性宫颈炎，阴道炎尿道炎外，还能经生殖道上行感染。有可能引起急慢性输卵管炎。子宫内膜炎等盆腔炎症。治疗沙眼衣原体感染多采用口服抗生素，可选用强力霉素每次一百毫克。
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2积极治疗是患者首先要重视的，由于服药方便，服药疗程亦不很长。因此患者只要，予以重视即能完成治疗。患者的配偶应该同时参与检查和治疗，治疗后复查一确认是否痊愈！在生活中一定要明确这两点，既要积极治疗，又不要再将病原体传给别人。
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3沙眼衣原体感染的治疗目的是治愈感染。防止产生并发症，阻断进一步传播。治疗原则是早期发现，早期治疗，用药足量，足疗程，性伴侣需同时治疗。成人沙眼衣原体尿道炎，子宫颈炎直肠炎可利用阿奇霉素四环素等治疗。
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沙眼患者应注意眼部卫生。不可过度用眼。疫苗在试用，效果不确定。注意个人卫生不时用公共毛巾和脸盆避免直接或间接接触感染。要注意积极治疗，服药方便，服药疗程不宜太长。注意卫生以免传染给别人。