甲胎蛋白一般存在于胎儿发育早期的肝脏和卵黄囊中，出生后逐渐消失，在正常人体中，含量极低，通常小于25μg/L。临床常将甲胎蛋白用于肝癌的普查和早期诊断，也用于肝癌切除术后疗效评估。检测值偏高时，有助于帮助诊断肝癌。同时针对不同的人群，结果出现偏高的临床意义也不同。
一、普通人群：
若甲胎蛋白值升高但仍在400μg/L以下时，通常考虑为急慢性肝炎、肝硬化等疾病。良性肝病可出现甲胎蛋白值一过性增高，一般经过积极治疗后即可逐渐下降至正常值。若甲胎蛋白值持续上升，则需考虑肝癌的可能，需要通过B超、CT等辅助检查手段进行鉴别诊断。
二、孕妇：
1、生理因素：妊娠3个月时孕妇的血清甲胎蛋白值也会升高，7-8个月达最高值，分娩后3周恢复正常。所以如果是在怀孕期间出现血清甲胎蛋白偏高，一般＜400μg/L，无需过于担心；
2、病理因素：如果是孕妇血清甲胎蛋白异常升高，则考虑可能是胎儿脑积水、先兆流产、胎儿宫内窒息等情况发生。如果是羊水甲胎蛋白偏高，通常见于无脑儿或脊柱裂胎儿，或者先天性肾病、食道闭锁、先天性性腺发育不全等胎儿畸形情况。
此外，甲胎蛋白升高也可见于胃癌肝转移、畸胎癌、卵巢胚胎性肿瘤，还可能是胃癌、结肠癌、胰腺癌、卵巢癌、睾丸肿瘤、胆管细胞癌等，需要进一步检查妇科超声或腹部超声、CT甚至穿刺活检明确诊断。
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