偶尔使用净水片一般没有严重副作用，但若长期大量使用，可能会存在一定的副作用。净水片是一种化学药物，具有一定的消灭细菌、抑制病毒的作用，有助于净化不干净的水，其消毒效果迅速并且持续时间较长。但其主要成分为氯或碘，长期大量饮用净水片消毒过后的水，人体可能会吸收过量的化学物质，从而导致一定的副作用。因此要尽量减少使用，可以偶尔少量饮用，适合野外生存、灾后没有干净水源等情况。
净水片主要是通过化学反应，从而起到灭杀致病菌的作用，但氯使用后会产生致癌的三卤甲烷，而碘会使水产生难闻的味道，长期大量饮用可能会对人体产生不良的影响。此外，净水片也不能过滤水中的杂质、重金属等有害物质，必须使用水质较好的河水、泉水。若水质不好，喝起来会有较多杂质，不适合饮用。如果身处野外或遇到自然灾害没有干净水源时，可以少量饮用净水片消毒过的水。