无籽西瓜对人体无害，有些人认为无籽西瓜对人体有害，可能是考虑无籽西瓜属于转基因食品，但其实并不是。无籽西瓜是在二倍体西瓜和四倍体西瓜的基础上进行人工培育杂交的三倍体西瓜，属于基因重组，但并没有改变基因，只是使西瓜没有籽，也没有繁殖能力，除此之外和普通西瓜没有区别。
而转基因食品指通过转基因技术培育的生物品系，市面上可以见到的转基因食品，安全性也得到了有效验证，生产也得到了严格管理，并不会造成食品安全问题。
无籽西瓜和普通西瓜一样，含有大量的水分和碳水化合物，还含有多种维生素，如胡萝卜素、核黄素、烟酸、维生素C等，以及矿物质元素，如钙、磷、钾、钠、镁等，吃无籽西瓜可以补充水分和能量，还可以促进代谢，利于排尿，而且吃起来比较方便，建议根据自己的喜好选择有籽西瓜或无籽西瓜。
无籽西瓜对人体的危害其实和普通西瓜一样，一般来说适量食用无籽西瓜并不会对身体产生害处，但吃得过多或吃了刚从冰箱里拿出来的冰西瓜，就有可能刺激胃肠道，导致腹泻、腹胀等不适症状出现。对于血糖控制不佳的糖尿病患者而言，吃西瓜会导致血糖升高，不利于病情稳定。对于慢性肾病、肾功能不全的患者，过多食用西瓜也会导致病情加重。