鹿胎粉虽然有一定调节内分泌的作用，但长期吃鹿胎粉可能会造成月经紊乱、乳汁分泌异常，以及血压升高、血糖升高的副作用。因此，鹿胎粉需在医生指导下服用，不可长时间、自行服用鹿胎粉，以免引起各种副作用。
1、月经紊乱：干扰女性正常月经，可能会导致月经量过多、月经淋漓不尽，甚至崩漏等副作用，影响其正常工作和生活，严重时可能会导致不孕不育；
2、乳汁分泌异常：哺乳期女性吃鹿胎粉后，容易导致机体内泌乳素分泌出现异常，可能引起乳汁分泌异常或乳腺管阻塞。如果哺乳期女性乳汁分泌不足或无法正常分泌，可能会出现乳腺相关疾病，且容易导致婴儿营养不良，从而影响正常的生长发育；
3、血压升高：鹿胎粉内含有可溶性蛋白、脂肪等，如果长期吃鹿胎粉，有可能导致血压升高。因此高血压的人群一定由医生判断是否适合吃鹿胎粉，谨防出现高血压危象的表现，从而危及自身生命；
4、血糖升高：鹿胎粉内还含有较多的糖类物质，如果长期吃鹿胎粉，也可能引起血糖升高，出现糖尿病。早期可出现三多一少的表现，即多饮、多食、多尿、体重减少，严重时可能会出现糖尿病足、失明、肾衰等并发症。
除了长期吃鹿胎粉可能引起的上述副作用外，还需注意并不是所有人均适合吃鹿胎粉，如果感冒期间吃鹿胎粉，则可能造成感冒进程延长，如果未成年人长期吃鹿胎粉，则容易造成性早熟，如果孕妇吃鹿胎粉，则可能造成流产或早产。子宫肌瘤、乳腺结节等激素依赖性疾病的女性，如果长期吃鹿胎粉，则可能影响体内雌激素合成，导致肌瘤或结节生长速度加快，从而导致病情加重。
