目前试管婴儿胚胎移植主要包括移植第三天的胚胎，或者是第五天、第六天的囊胚。囊胚移植成功率要略高于胚胎移植，同时早产的概率也低于胚胎移植，但是囊胚移植的后代，通过随访，新生儿体重大于4kg的可能性要稍微高于胚胎移植，所以囊胚移植并没有什么禁忌。
很多国家都选择单囊胚移植，单囊胚移植成功率要高于胚胎移植。有的高龄试管婴儿患者，比如40岁以上的患者，她本身获得胚胎的数目就比较少，如果在体外养成囊胚，形成囊胚的可能性就更少，甚至有可能没有囊胚可以移植的可能性，这种情况是可以考虑胚胎移植的，但原则上囊胚移植是没有禁忌的。