耳根疼痛，考虑是耳朵深部疼痛。耳部疼痛，有炎症性疾病引起的疼痛，也有各种原因引起的神经性耳痛。
耳本身疾病引起疼痛，有各种耳部外伤引起疼痛，也有各种炎症引起的耳痛。耳朵炎症引起的疼痛为常见，如外耳道炎、外耳道疖、外耳道胆脂瘤伴感染、大疱性鼓膜炎、急性中耳炎及耳部恶性肿瘤等。有发生于邻近或远隔器官导致继发性耳痛，如口腔、咽喉、颞颌关节及颈部的疾病，由神经反射到耳部，而导致耳深部疼痛。如下颌智齿阻生、颞颌关节炎、急性化脓性扁桃体炎、扁桃体周围炎、咽喉部恶性肿瘤或溃疡等咽喉部疾病；以及颈性关节炎等。以上的这些疾病导致的耳深部疼痛，都可以引起牵涉性耳痛。
耳部炎症引起的疼痛，往往是持续性疼痛。而其他原因引起的耳痛，常伴有耳朵以外的症状，如咽喉部疾病引起的耳痛，和吞咽时有关，并伴有咽喉部疼痛症状。