紫草根指紫草的地下根部分，而紫草是指整株植物，包括根、茎、叶，但紫草一般以根入药。因此，中医上的紫草根和紫草一样，一般都指紫草根，是一种比较常见的中药材。
紫草根味甘、咸、性寒，归肝经和心经，具有解毒透疹、清热凉血、活血的功效，在临床上主要用于治疗温毒发斑、疮痒、湿疹、烫伤等，还对湿热黄疸、热结便秘、淋浊有一定的功效。在麻疹高发的季节中，服用紫草根还有助于预防麻疹。紫草是整株植物，主要以根入药，茎和叶没有太大的药用价值，一般不作为药用。
紫草根性寒，可能会对脾胃造成损伤，所以用药前一定要通过中医医生的辨证，如果本身脾胃虚弱，而且有大便溏泄的人群则不宜服用，麻疹已经透出者也不宜服用。