多重耐药菌是指细菌对三类或者三类以上的抗菌素同时耐药。此类病菌的特性与普通的细菌基本相同，导致的临床症状也没有差异，仅从临床表现上不足以进行区分。常见的症状是发热、寒战、头痛、食欲减退等，另外根据感染部位的不同，可出现不同的表现。
1、呼吸道感染：呼吸道出现的多重耐药菌感染可导致患者出现咳嗽、咳痰等症状，严重时可引起胸闷、呼吸困难表现，如果是出现肺炎，并且炎症波及胸膜，则还可引起胸痛等表现；
2、泌尿系感染：可分为下尿路感染以及上尿路感染，感染多重耐药菌后可以出现尿频、尿急、尿痛等尿道刺激症状，伴有上尿路感染者，还可出现腰痛、肾区叩击痛等症状；
3、消化系统感染：比如多重耐药菌感染引发胆囊炎，患者可出现腹痛、恶心、呕吐、黄疸等症状。
因为多重耐药菌感染的临床症状无特征性，所以不能根据症状区分是敏感菌感染或多重耐药菌感染。如果出现上述感染症状的患者常规抗感染效果不好，则需考虑多重耐药菌感染的可能，建议通过细菌培养来确定，比如痰培养、血培养、尿培养等。