部分枕大神经痛常因风寒、感冒引起，也可因颈部外伤、增生性颈椎病等颈椎病变所致，同时还可以由脊柱结核、肿瘤、骨关节炎等原因引起，但还有部分枕大神经痛病因尚不明确。
一、主要病因
1、由于外伤、撞击等原因，导致枕大神经受到刺激、卡压，影响到局部肌肉，造成神经痛。
2、颈椎病等慢性疾病，或由于长期劳累、长期低头伏案，也容易导致神经卡压。
3、在枕大神经出口处的颈部，如小关节错位，可影响到神经的支配能力，诱发疼痛。
4、女性在月经期因内分泌改变，而影响到血管的调节能力，产生疼痛。
5、脑脊膜炎继发、神经瘤术后、带状疱疹感染等炎症以及肿瘤原因而引起。
6、由于长期存在枕肌炎、血管强直或者肌肉痉挛这些疾病，从而导致枕区疼痛。
7、由于血管存在舒张或者收缩功能障碍导致该疾病的发生。
二、诱发因素
1、不良生活习惯：长期低头工作、劳累、紧张、休息不好等都可以是诱因。
2、全身免疫力降低：如结核、风湿、糖尿病等，或患有上呼吸道感染、慢性扁桃体炎时，导致枕下三角区局部微环境理化性质的改变，可诱发枕大神经痛。