畸胎瘤是来源于生殖细胞的肿瘤，生殖细胞异常分化会导致畸胎瘤的形成，遗传因素、环境因素、内分泌因素都会导致畸胎瘤的产生。
一、主要病因
1、生殖细胞异常：生殖细胞在生长、分化、成熟的复杂过程中出现异常，就可能形成畸胎瘤。可根据畸胎瘤中细胞的成熟程度确定其良恶性，若多数分化成熟则为良性，反之为恶性。
2、年龄：处于青春期患者的睾丸发生急畸形，一般为良性，而青春期后患者睾丸畸形为恶性。另外，恶性卵巢畸胎瘤多发于20岁以下的女性。
二、诱发因素
1、生活习惯因素：不良的饮食结构、精神压力太大、生活不规律都会间接的造成畸胎瘤的产生。
2、遗传：患有遗传性疾病者有一条额外或缺失的性染色体。
3、内分泌因素：内分泌系统的失常，因为体内的雄性激素过多而产生。
4、环境因素：过量吸烟和接受过度辐射可能会造成畸胎瘤。