在不同医院的不同科室，要求查的免疫三项可能不同，可能是指免疫球蛋白三项，也可能是指传染病三项，要根据具体情况来定。如果是查免疫球蛋白三项，主要包括免疫球蛋白G、免疫球蛋白A，以及免疫球蛋白M，这三项是检查体液免疫功能的重要指标。当怀疑患者有免疫功能低下或者自身免疫病以及感染时，这三项指标会出现异常。
此外，手术之前或者孕妇进行孕检时，可能会查传染病三项，有的医院也叫免疫三项，一般是查乙肝、梅毒、艾滋病，可以分别进行肝功能化验、梅毒血清鉴定试验、HIV检测，通过这些检查可以判断体内是否有HIV、梅毒螺旋体、乙肝病毒感染。如果有一种及以上抗体显示阳性，提示检查者可能患有某一种疾病。
患者到医院就诊时，医生会根据不同的症状、体征来给予相应的免疫三项检查。检查前的一段时间，饮食要尽量以清淡为主，检查前一天晚上建议10点后不要再吃饭、喝水，以免影响第二天的检查结果。