月经总推迟常与女性特异内分泌疾病相关，要检查女性性激素六项和甲状腺功能，除外多囊卵巢综合征、高泌乳素血症、甲状腺功能异常、卵巢功能早衰等特异内分泌疾病。这些疾病常有月经推迟的表现，有各自的临床特点和激素表达特点，需要做出鉴别和处理。
高泌乳素血症一般表现为血泌乳素升高，常需要给予甲磺酸溴隐亭治疗。如果有垂体瘤需要手术治疗，而多囊卵巢综合征表现为雄激素升高或者LH偏高。对于月经失调，多给予达英-35等短效口服避孕药替代治疗，调整月经周期。如果有不孕，对于希望妊娠者，一般要给予促排卵治疗，有时需要试管婴儿。