发烧的时候机体代谢率会增快，会伴随着大量的无氧酵解，因此会产生大量的乳酸堆积在肌肉当中，就会产生全身酸痛的感觉，而在发烧的时候，机体对组织胺、缓激肽等致痛物质的反应会增强，因此也能引起来肌肉酸痛，发烧最常见的原因就是感染性疾病，常见诱因有细菌感染、病毒感染、支原体、衣原体等非典型病原菌感染，都能够引起发烧。
如果是病毒感染引起来的发烧，可以给予抗病毒治疗或者中医中药辨证治疗。如果是细菌感染引起来的发烧，可给予抗生素抗感染治疗，常用的有青霉素类的阿莫西林克拉维酸，头孢菌素类的头孢呋辛、头孢克洛、头孢羟氨苄，或者大环内酯类的阿奇霉素、红霉素、罗红霉素。如果是大于18岁以上的成人，也可以用喹诺酮类的抗生素，比方说甲磺酸左氧氟沙星、莫西沙星等。如果是支原体、衣原体等非典型病原菌感染引起的发烧，可以用喹诺酮类的抗生素或者大环内酯类的抗生素进行抗感染治疗。当然也有非感染因素引起的发烧，比方说免疫系统疾病引起来的发烧，此时根据患者的情况、疾病，来选用激素类的药物或者细胞毒性的药物进行治疗。