声带囊肿的病因复杂多样，不同类型的声带囊肿有不同的起病原因。潴留囊肿的形成多系声带腺管阻塞所致，而表皮样囊肿的形成原因，目前尚不清楚。
一、主要病因
1、声带腺管阻塞：声带黏液囊肿的形成多是由炎症刺激使声带腺管阻塞，分泌物潴留而形成。
2、外伤：因发声不当所致的轻微外伤、炎症或直接损伤声带上皮，均可产生细小的裂隙而导致表皮样囊肿的形成。
3、胚胎错构：表皮样囊肿是先天性发育异常所致，由于表皮样囊肿多伴有声带沟或“黏液桥”的存在，声带沟可能为声带囊肿发展进程的一个阶段，故此类患者可无用嗓过度或喉炎病史。
二、诱发因素
1、炎症：慢性喉炎、咽炎、上呼吸道感染等都是诱因。
2、喉部外伤：外伤损伤喉部声带上皮、或声带腺管而致病。
3、用嗓不当：长期发声不当、或者发声过度导致声带反复受损，可能诱发囊肿形成。
4、长期刺激：酒精、寒冷食物等长期刺激咽喉部造成慢性损伤而致病。
5、手术：甲状腺手术或其他喉部手术，可能意外损伤声带引起囊肿形成。
6、环境因素：如环境过冷或者过热的时候，容易对声带造成影响，如在冬天，不注意保暖，大声说话的时候，冷空气容易对声带造成刺激，损伤声带，出现声带囊肿。