柠檬籽在正常情况下没有毒，柠檬籽有毒的说法没有科学依据。柠檬籽一般可进行适量食用，其中含有柠檬苦素及维生素C等物质，不会导致人体中毒，还能为机体补充相应的营养物质。对于患有口角溃烂等不适的人群，适当摄入柠檬籽，对于促进恢复具有一定帮助。
柠檬籽中含有的柠檬苦素，会导致其具有一定的苦味，但属于一种重要的生物活性物质，对身体一般不会产生害处。除此之外，吃柠檬籽时也需注意适量，柠檬籽通常是在食用柠檬的时候同时摄入，也需避免一次性吃太多，否则可能会对胃黏膜造成刺激，引起腹痛等情况。并且在日常生活中，除了适量食用柠檬籽、柠檬以外，也需要同时补充其他蔬果，比如香蕉、葡萄等，防止因吃单一食物过多，而引起营养不均衡的现象。