肾囊肿出现之后，需要根据肾囊肿的大小来选择治疗方法。如果单纯性肾囊肿没有任何表现，但已经大于4cm，可以考虑外科干预，最常用的是肾囊肿穿刺硬化术，方法简单，操作方便，创伤非常小，可反复使用。如果没有任何表现，但已经大于8cm，可以选择肾囊肿去顶减压术，最常用的是腹腔镜微创手术，创伤小，恢复快，较开放手术有明显的优势。如果单纯性肾囊肿出现压迫梗阻，无论大小都应尽早处理，也可以先选用肾囊肿穿刺硬化术。
出现肾囊肿的话，如果囊肿大于5厘米，最好治疗方法就是手术治疗。手术方式包括有三种。第一种，间皮肾囊肿穿刺硬化剂固定，这种手术创伤小，恢复快，但是容易复发。第二种，腹腔镜肾囊肿去顶减压手术，这是一种微创的手术方式，创伤小，恢复快，出血少。第三种，开放型肾囊肿去顶减压，创伤大，一般不建议采用这种手术方式。