南瓜子可以生吃也可以熟吃，生吃的情况下不会导致南瓜子的营养成分流失，也不会对机体产生危害，但是生吃的口感没有熟吃口感好。
南瓜子中的营养成分较丰富，含有多种脂肪酸，如油酸、亚麻酸、硬脂酸、花生酸等，同时也含有大量的矿物质元素以及维生素，适当食用后可以为人体提供营养，提高机体的抵抗力，同时南瓜子中的有害物质较少，通常生吃也不会对人体健康造成影响。但生吃南瓜子没有炒熟之后的南瓜子口感好，生吃南瓜子的口感较涩，炒熟之后南瓜子会变得比较香。虽然南瓜子对人体健康有好处，但由于南瓜子中的脂肪含量较高，在过量摄入后，可能会导致热量摄入过高，脂肪堆积后会出现肥胖，所以对于身体较肥胖，以及正在减肥期间的人群要减少摄入量，同时对于高血压，以及胆固醇高的人群，也要控制好摄入量。
日常生活中需要注意保证营养均衡，避免挑食造成营养不良，如果在食用南瓜子后出现了腹痛、腹胀、腹泻等不良反应，建议及时到医院就诊，完善相关检查。