饭后腹胀提示消化不良，消化不良分为器质性病因引起的消化不良和功能性的消化不良。消化道的任何脏器疾病都可以引发消化不良，如胃部的疾病，包括胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡、胃癌等等，肝脏的疾病，如慢性的肝炎、肝硬化、肝脏的肿瘤，胆囊的疾病，如慢性的胆囊炎、胆囊的结石，以及胰腺的疾病，如慢性胰腺炎。
还有肠道的疾病，如肠道的炎症性疾病，如感染性肠炎以及溃疡性结肠炎等等，这些器质性疾病引发的腹胀，需要针对病因进行治疗。在临床上大部分都是功能性的腹胀，也就是没有什么器质性的原因，患者只是存在肠道内气体产生过多，或者因为胃肠道对气体的容受功能下降而引发的腹胀，这一类病人可以口服调节胃肠道功能帮助消化及调节肠道菌群的药物进行治疗。