骨髓移植对捐献者通常并无危害和后果，也不会影响捐献者的日常生活。骨髓移植捐献者在骨髓抽取过程中，可能会出现疼痛症状，或乏力、燥热等表现，极少数捐献者可能会出现过敏、脾肿大。
过去的骨髓移植，是在捐献者体内抽取部分骨髓，输入到患者的体内，用捐献者正常的骨髓细胞取代患者不正常的骨髓细胞。正常人体中的骨髓有较强的再生能力，在失去一部分后，一段时间内即可逐渐自行恢复，不会影响捐献者骨髓的正常功能，也不会产生后遗症及危害。虽然在抽取骨髓过程中，捐献者可能会出现不同程度的疼痛症状，但大多数可以耐受，疼痛在抽取骨髓后即可消失，持续时间不长。
另外，随着技术增长，在临床上的骨髓移植，已经逐渐变为采集捐献者的外周血干细胞，而不是骨髓。指的是通过使用药物刺激捐献者的骨髓，释放干细胞到外周血中，利用仪器采集捐献者的干细胞再回输给患者的操作。整个过程与正常人献血一样，没有较大痛苦，少数捐献者在捐献后，暂时出现乏力、燥热、过敏、脾肿大等身体虚弱情况，但一般恢复较好，无明显危害。