脂肪肝的治疗应该主要针对形成脂肪肝的原因，采取有针对性治疗措施。如果脂肪肝是由于摄入过多体重增加引起，就要改变生活方式，应该以高蛋白、低脂、低糖饮食，同时还要注意避免零食以及甜饮料，每顿饭应该以6-7分饱为主。同时还要注意忌酒，因为脂肪肝体重增加再加上喝酒，脂肪肝会有双重因素，所以这类病人也要注意忌酒。同时还要注意加强运动，可以慢跑、快走、游泳、爬山等等。
对于脂肪肝是由于酒精引起的，要注意忌酒，任何含有酒精饮料以及酒类都要避免，同时酒精性脂肪肝往往伴有营养不良，需要高蛋白饮食，注意补充营养。如果脂肪肝是由于药物导致，比如长期服用糖皮质激素以及三苯氧氨等等一类药物，可以引起脂肪变性。这个时候就要权衡利弊，是否有替代药物，要定期观察，同时还要注意生活方式改变。
如果脂肪肝是由于糖尿病引起，还要注意糖尿病控制。如果脂肪肝是由于营养不良造成，有些病人减肥造成营养不良，反而引起脂肪肝，这一类病人还要注意高蛋白饮食补充营养。对于以上病因引起的脂肪肝，如果是单纯脂肪肝，转氨酶不高，可以不采用药物治疗。如果引起转氨酶升高，就导致了脂肪性肝炎，还要应用抗炎、保肝药物。