正常人群偶尔吃一次，或少量食用皮蛋其实不会有什么危害，但由于皮蛋属于腌制品，在制作过程中需要放入红茶摸、纯碱、生石灰等材料，再经过长时间封闭腌制才能制作成功，而在这一过程中会产生多种有害元素，长期食用可能会产生危害。
皮蛋制作过程中会产生铅，过量食用皮蛋会导致铅元素摄入过量，进而引发铅中毒，对人体的神经系统、血液系统和免疫系统都会造成一定损害。尤其是儿童过量食用引发铅中毒后，可能出现注意力难以集中、智力发育异常、运动能力下降、贫血等情况。
皮蛋中的物质还可能影响人体对维生素和矿物质的吸收，过量食用可能加重钙元素的流失，对肾脏、骨质都会产生危害，尤其对老人、儿童的身体影响更为明显。
另外，皮蛋本身性质偏凉，本身体质偏寒凉的人群过量食用容易引发腹痛、腹泻，可能损伤人体的脾胃，尤其经期女性大量食用后容易加重痛经迹象，因此不建议过量食用，但是正常食用皮蛋一般没有较重危害。