免疫系统疾病一般比较多，正常情况下分为自身免疫病、免疫缺陷病这两种，主要为遗传因素、环境因素等多种因素导致。
1、自身免疫病：自身免疫病主要为免疫系统对宿主自身成分表现出免疫反应性增高，对自身组织造成损害所致，一般包括类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、干燥综合征、系统性硬化症、皮肌炎；
2、免疫缺陷病：免疫缺陷疾病主要是由机体免疫系统发育不全或免疫应答障碍所致，根据病因又分为原发性免疫缺陷病和继发性免疫缺陷病。原发性免疫缺陷病一般包括T细胞免疫缺陷病、X-连锁无丙种球蛋白血症、慢性肉芽肿病等，继发性免疫缺陷病主要是艾滋病。