生吃西红柿可有效摄入其中的维生素C，而且西红柿味道酸甜，可增进食欲，有分解脂肪、生津止渴、健胃消食之功效，所以生吃西红比较好。但是不能生吃未成熟的西红柿，因为其中含有有毒的番茄碱，而且毒量较大，生吃后容易出现头晕、恶心、呕吐、乏力等不适。
此外，西红柿内含有一定量的胶质物和有机酸，空腹生吃西红柿会导致胃部不适。而将西红柿做熟之后食用，可提高番茄红素的抗氧化功效，因为高温会破坏其细胞壁，炒熟后食用油还可充分释放番茄红素等脂溶性抗氧化剂，有延缓皮肤松弛、衰老、保护视力等作用。
但是西红柿加热后其维生素C含量会受到一定量的损失，所以可生吃、熟吃交替食用。需要注意的是，农药可能会残留在西红柿表面，所以生吃西红柿时需将其清洗干净或者去皮食用。