手足口疫苗在临床上一般指手足口病疫苗，简称为EV71疫苗。接种EV71疫苗后可以让自身产生针对EV71的抗体，从而预防EV71感染所致的手足口病。
手足口病是由肠道病毒所引起的急性传染病，其中以CoxA16和EV71感染最为常见，但临床正在应用的手足口病疫苗仅针对EV71病原体，因此简称为EV71疫苗。手足口病主要通过消化道、呼吸道和密切接触传播，多发生于学龄前儿童，尤其3岁以下的儿童发病率最高。因此，建议符合EV71疫苗接种条件的儿童尽早完成接种。大于6月龄的易感儿童，一般越早接种越好，建议在12月龄前完成接种程序。而对于5岁以上儿童而言，则不推荐接种。
对于6月龄至5岁的儿童来说，如果曾患手足口病，但未确诊为EV71感染导致的重症手足口病，考虑到引起手足口病病原体的多样性，仍然建议接种EV71疫苗。需要注意的是，对EV71疫苗中任何一种成分过敏、发热、处于急性疾病期及慢性疾病急性发作期的儿童不可以接种EV71疫苗。