炒芥子的副作用主要就是助长热邪、耗伤气阴，禁忌证为肺热咳嗽或阴虚火旺等情况的人群应谨慎使用，这与炒芥子及其原生药材芥子的性味归经及功效有关。
炒芥子为芥子炒制后的炮制品，其具有辛、温的性味，归肺经，具有温肺豁痰、散结通络止痛的功效，可以治疗寒痰咳嗽、胸胁胀痛、痰滞经络等疾病。而芥子味辛，性热，归胃、肺经，具有温中散寒、豁痰利窍、通络消肿的功效，主要用于胃寒呕吐、心腹冷痛、咳喘痰多等疾病的治疗中。炒芥子相对于芥子来说要偏性更小一些，经过炮制其辛散走窜之性有所缓和，在药方中应用时能够一定程度上避免耗气伤阴，但毕竟其性还是并未完全改变，属于偏辛温的，所以在有明确肺热咳嗽或阴虚火旺的人需谨慎使用，可能会助长热邪，耗伤气阴。
临床上对于药物在方中的使用，通常需要遵守君臣佐使的原则，除特殊情况外很少会单味行药。所以在服药时无须过于担心药物偏性，谨遵医嘱服药，避免擅自用药即可。