头孢哌酮属于第三代头孢菌素类的药物，头孢哌酮在使用期间有可能会导致药物不良反应。最常见的是胃肠道不良症状，例如恶心、呕吐、腹痛、腹泻，甚至会出现假膜性肠炎。头孢哌酮还可能会在部分患者中出现过敏反应，表现为皮疹、荨麻疹或者瘙痒，极少数患者甚至可能会出现过敏性休克。另外，头孢哌酮需要经过肝脏、肾脏代谢，所以部分患者在用药后可能会出现肝功能异常，出现转氨酶的升高或者胆红素升高。此外还能导致肾功能异常，导致尿素氮和血肌酐升高。头孢哌酮片还可能会引起造血功能异常，出现中性粒细胞减少以及血小板减少等，以上药物不良反应在停药后都能自行恢复。
