碘液和碘酒有区别，主要是颜色、气味、效果等的不同，但二者都含有碘，而且遇强光都会分解，所以都要装在深棕色瓶子里保存。
1、颜色：碘液是碘的水溶液，颜色为棕褐色；碘酒是碘与碘化钾的酒精溶液，颜色为红棕色；
2、气味：碘液具有轻微刺激性气味；碘酒里有酒精，所以会有酒精一样的特殊气味；
3、效果：碘液杀菌力强、杀菌范围广，而且刺激性小，不会发生过敏反应，能直接接触身体皮肤、黏膜、伤口，不会产生灼烧感，对各种致病菌、病毒、真菌及芽孢都具有强大的杀菌效果；碘酒对身体皮肤、黏膜、伤口的刺激性比较大，对细菌、病毒、真菌等都有较好的杀菌效果，能够渗入皮肤组织起到杀菌作用，在临床上主要可以用于皮肤消毒；
4、用途：碘液可以用于生物试验，碘液可以使细胞核染成棕黄色，使生物载玻片在显微镜下观察时物像更清晰，实验结果更准确；碘酒不能用于部分生物试验，例如对于细胞的染色试验，由于碘酒中碘的浓度大，容易导致植物细胞质壁分离，导致细胞失水，碘酒通常用于皮肤消毒。
