一般而言，正露丸药物说明书中虽然并未标明有什么副作用，但根据临床经验，有少部分患者服用后通常会出现胃肠道不适、过敏反应。正露丸主要具有化滞止泻的功效，多用于湿热、食滞证者，症见食欲不振、恶心呕吐、腹胀腹泻、消化不良等。
1、胃肠道不适：正露丸作为一种中成药，其中含有的中药材成分较多，如木馏油、阿仙粉、黄柏粉、甘草粉、陈皮粉等，同时也还含有羧甲基纤维素钙、甘油、水、桂皮粉等辅料。因此在服用后可能会刺激胃肠道黏膜，继而出现脘腹胀满、腹痛、恶心等胃肠道不适症状；
2、过敏反应：同时由于正露丸中的成分较多、较复杂，也不排除患者可能会对其中的某一种成分过敏，继而在服用后可能会出现过敏反应，如发热、皮肤瘙痒、皮肤红斑等症状。因此之前在服用正露丸出现过过敏症状的人群，在后续生活中则需要避免再次使用该药，以免再次诱发过敏症状。除此之外，若是在使用该药物后3天症状未见好转，应及时前往医院的中医科就诊，并在医生指导下更换药物治疗。
由于正露丸中含有黄柏等性寒的中药材，所以在服用正露丸期间不宜同时服用温补性中成药，如桂茸固本丸等，否则可能会导致药效降低。同时对于脾胃虚寒，症见腹痛、喜暖、泄泻者也需要谨慎使用。
